2018-05-15

　　作者 趙泓維

　　基因測序價(jià)格的向下飛躍給予了基因監(jiān)測、精準(zhǔn)治療領(lǐng)域極大的價(jià)值。與此同時(shí)，基因數(shù)據(jù)的儲存與分析處理成為眾多企業(yè)追逐的香餑餑。在這個(gè)時(shí)代，掌握了數(shù)據(jù)就掌握了主動(dòng)權(quán)。

　　DNAnexus就是這樣一家公司，在眾多基因數(shù)據(jù)儲存企業(yè)中脫穎而出。它專注于為用戶提供DNA數(shù)據(jù)儲存、共享、分析、管理等服務(wù)。2018年1月，公司結(jié)束E輪融資，融資金額總計(jì)5800萬元。

　　基因數(shù)據(jù)的儲存、管理與分析

　　基因組測序的發(fā)展面臨三大挑戰(zhàn)：

　　第一，需要極大的磁盤空間存儲基因組大數(shù)據(jù)；

　　第二，需要足夠快的網(wǎng)絡(luò)傳輸速度促進(jìn)數(shù)據(jù)共享；

　　第三，基因組大數(shù)據(jù)的分析和處理預(yù)計(jì)會話費(fèi)數(shù)萬億個(gè)CPU小時(shí)。

　　一般而言，研究機(jī)構(gòu)或醫(yī)院沒有足夠的儲存空間儲存如此巨量的數(shù)據(jù)。即便有能力儲存，但也不能保證收集的數(shù)據(jù)立即派上用場，這也會帶來一大筆成本，超過儲存數(shù)據(jù)帶來的收益。

　　DNAnexus的云儲存功能完全契合醫(yī)院、研究機(jī)構(gòu)的需求，它的存儲中心可以低成本、高速率存儲和調(diào)用數(shù)據(jù)。

　　為了保證數(shù)據(jù)能夠快速上傳至云端，DNAnexus提供多種方式上傳云端數(shù)據(jù)。用戶可以使用命令行上傳；通過網(wǎng)絡(luò)平臺上傳；從URL獲??；或者通過DNAnexus API直接上傳。

　　DNAnexus平臺的API支持任何數(shù)據(jù)格式及基于Linux的軟件。通過DNAnexus平臺，生物制藥公司及其合作伙伴可以根據(jù)PHI要求安全地搜索患者健康狀況和遺傳學(xué)之間的關(guān)系。

　　生物制藥公司可使用DNAnexus與醫(yī)療健康合作伙伴進(jìn)行聯(lián)系，將患者表型信息和基因組信息結(jié)合起來，推動(dòng)開展藥物發(fā)現(xiàn)、挑選臨床試驗(yàn)參與者等活動(dòng)。

　　除了支持任何數(shù)據(jù)格式之外，該平臺的API還支持與LIMS，測序儀器以及三級分析和報(bào)告軟件的端到端集成。DNAnexus提供全球網(wǎng)絡(luò)，將制藥公司與醫(yī)療保健提供商，醫(yī)院和臨床實(shí)驗(yàn)室連接起來，以加速基因組學(xué)在診所的影響。

　　所有上傳的數(shù)據(jù)均會在云端加密，整個(gè)傳輸過程都將被跟蹤控制。DNAnexus把數(shù)據(jù)的安全性問題看作自己的核心目標(biāo)之一，在一般情況下，用戶可以完全放心基因數(shù)據(jù)的安全性。

　　DNAnexus的服務(wù)也可解決基因組測序面臨的第三個(gè)問題。它提供1000個(gè)節(jié)點(diǎn)，可同時(shí)處理百萬個(gè)對象。用戶可在云端直接執(zhí)行數(shù)據(jù)分析，無需下載海量數(shù)據(jù)(603138)。同時(shí)，整個(gè)使用過程也將全程進(jìn)行加密處理。

　　DNAnexus曾分別與斯坦福大學(xué)與貝勒醫(yī)學(xué)院合作推出了一個(gè)大型項(xiàng)目以展示該平臺對于大規(guī)模基因數(shù)據(jù)處理的價(jià)值。在這兩個(gè)項(xiàng)目里，DNAnexus 共處理了17000個(gè)基因組，生成的基因數(shù)組超過500TB。所生成數(shù)據(jù)可在平臺上訪問供后續(xù)分析與數(shù)據(jù)共享使用。

　　DNAnexus及其團(tuán)隊(duì)

　　DNAnexus的成立可以追溯到2009年的斯坦福大學(xué)，位于灣區(qū)三藩市山景城。DNAnexus是一家B2B的基因大數(shù)據(jù)公司，為基因公司的大數(shù)據(jù)分析和管理提供云平臺服務(wù)。

　　Richard Daly任DNAnexusCEO，他在健康管理和基因組學(xué)領(lǐng)域面擁有三十年的管理經(jīng)驗(yàn)。

　　Daly過去在健康管理和健康實(shí)驗(yàn)領(lǐng)域均成立過企業(yè)，同時(shí)也是實(shí)驗(yàn)室基因測序和生物信息學(xué)先驅(qū)Visible Genetics(納斯達(dá)克股票代碼：VGIN)的首席執(zhí)行官。他曾獲得紐約大學(xué)金融學(xué)士學(xué)位和哈佛大學(xué)工商管理碩士學(xué)位。

　　首席技術(shù)官George Asimenos博士自DNAnexus成立以來一直參與設(shè)計(jì)和調(diào)試DNAnexus產(chǎn)品線，并將其交付于全球客戶。他目前正在開展戰(zhàn)略項(xiàng)目，探索如何使用DNAnexus技術(shù)超越傳統(tǒng)基因組學(xué)界限。

　　George擁有斯坦福大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)博士學(xué)位，他曾在那里參與了人類組基因測序計(jì)劃。他的研究經(jīng)歷包括比較性宏基因組學(xué)，用于可重構(gòu)硬件的硅片編譯器和橢圓曲線密碼分析。

　　Andrew Carroll博士在DNAnexus任科學(xué)副總裁。他幫助運(yùn)行了最大的云基因組學(xué)項(xiàng)目，該項(xiàng)目與CHARGE Consortium和Baylor醫(yī)學(xué)院共同完成，涵蓋20,000個(gè)基因組/外顯子組，迄今為止進(jìn)行的最大的植物基因組學(xué)項(xiàng)目涵蓋了3000個(gè)水稻基因組計(jì)劃中的3000個(gè)水稻基因組。

　　通過DNAnexus科學(xué)團(tuán)隊(duì)的工作，他曾在個(gè)人和群體、基因表達(dá)分析、基因結(jié)構(gòu)變異分析、基因組組裝、腫瘤正常分析，計(jì)算化學(xué)和圖像處理等方面開展了SNP和indel調(diào)用的臨床和研究項(xiàng)目。他擁有斯坦福大學(xué)獲得博士學(xué)位，其學(xué)術(shù)工作涉及植物比較基因組學(xué)，蛋白質(zhì)組學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí)。

　　融資情況

　　從融資情況來看，領(lǐng)頭企業(yè)GV、TPG Biotech等均在投資領(lǐng)域有較高的知名度，其行為本身也隱含著極大的價(jià)值。

　　2015年4月，藥明康德(603259)獨(dú)投1500萬美元凸顯中國科技企業(yè)試圖打入基因市場的決心。

　　2018年初完成的E輪融資主要用于研究醫(yī)療解決方案，擴(kuò)大其在臨床醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域的發(fā)展。這可能隱含DNAnexus從基因數(shù)據(jù)出發(fā)，輻射精準(zhǔn)醫(yī)療各行業(yè)的野心。

　　微軟Healthcare NExT計(jì)劃中重要的一環(huán)名為Microsoft Genomics，這是微軟進(jìn)入精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域關(guān)鍵的一步。DNAnexus無疑可以讓微軟的工作事半功倍，未來發(fā)展可期。

　　未來發(fā)展

　　隨著基因組分析整合到臨床前階段和臨床階段，DNAnexus將提供全球網(wǎng)絡(luò)來幫助基因組和臨床數(shù)據(jù)整合分析，加速發(fā)掘基因差異對臨床結(jié)果的影響。

　　DNAnexus建立在Microsoft Azure和亞馬遜網(wǎng)絡(luò)服務(wù)的基礎(chǔ)之上，并擁有可擴(kuò)展的基礎(chǔ)架構(gòu)，可通過“單一平臺”立即滿足各類計(jì)算和數(shù)據(jù)存儲需求。在DNAnexus進(jìn)行分析計(jì)算時(shí)，所有數(shù)據(jù)和計(jì)算工具受同一系統(tǒng)控制，消除重復(fù)計(jì)算，可提高運(yùn)算速度并降低能耗成本。

　　對于臨床研究人員來說，DNAnexus網(wǎng)絡(luò)環(huán)境提供了一個(gè)人性化的操作界面。除了豐富的統(tǒng)計(jì)功能，DNAnexus平臺還允許醫(yī)療機(jī)構(gòu)開發(fā)新的分析工具。研發(fā)者既可以使用DNAnexus應(yīng)用程序庫中已有的組件，也可以將現(xiàn)有的應(yīng)用程序和管道移植到DNAnexus中。

　　從DNAnexus自身業(yè)務(wù)開展情況情況及技術(shù)研發(fā)、投資方參與情況及基因領(lǐng)域發(fā)展情況看，這家未來獨(dú)角獸的發(fā)展不可限量。隨著基因檢測技術(shù)深入百姓家，DNAnexus的業(yè)務(wù)量將迎來新的爆發(fā)點(diǎn)。