超聲波可以“看到”腫瘤細胞何時打開和關(guān)閉基因
摘要: 近日,《Science》雜志上發(fā)表的一則論文引起了各界的關(guān)注。美國加州理工學院的科學家們開發(fā)出一種全新的超聲成像系統(tǒng)。這一技術(shù)沖破了原有成像技術(shù)的桎梏,甚至還能看到腫瘤細胞基因何時最為活躍。
近日,《Science》雜志上發(fā)表的一則論文引起了各界的關(guān)注。美國加州理工學院的科學家們開發(fā)出一種全新的超聲成像系統(tǒng)。這一技術(shù)沖破了原有成像技術(shù)的桎梏,甚至還能看到腫瘤細胞基因何時最為活躍。

DOI: 10.1126/science.aax4804
現(xiàn)代細胞生物學家總會想各種辦法去窺看DNA片段,因為這些是解讀細胞功能的密碼。細胞不斷地打開或關(guān)閉基因從而控制細胞,科學家通過觀察DNA遺傳程序來了解細胞的功能。
研究人員通過編碼細胞外一種綠色熒光蛋白(GFP)的物質(zhì)來觀察。顧名思義,它是一種發(fā)出明亮綠色的蛋白質(zhì)。因此,如果研究人員想要更多地了解細胞是如何變成神經(jīng)元的,他們可以將GFP基因和神經(jīng)元基因一起插入胚胎的DNA中。當胚胎細胞打開神經(jīng)元基因時,它們也會表達GFP基因,細胞會發(fā)出綠光,這使得研究人員很容易發(fā)現(xiàn)編碼神經(jīng)元形成的基因程序是活躍的。
盡管這項技術(shù)一直有用,但它有一個很大的局限性:由于光線無法很好地穿透大多數(shù)生物組織,因此GFP基因無法用于監(jiān)測生物體內(nèi)深層細胞的活性。
超聲波沖破桎梏觀察基因
為了解決這一難題,加州理工學院的Mikhail Shapiro提出了新的解決方案。傳統(tǒng)醫(yī)學研究所化學工程教授兼研究人員Shapiro帶領(lǐng)研究生Arash Farhadi及其同事開發(fā)出了一種新的基因報告方式。他們使用超聲波觀察遺傳活性,相較于光線,超聲波可以穿透組織深處。這種非侵入性技術(shù)非常擅長窺探組織。

研究人員已經(jīng)使用超聲波來檢測腫瘤中的基因活性
科學家們從一些水生微生物中得到了靈感:這些微生物會在體內(nèi)形成一類特殊的蛋白結(jié)構(gòu),它們就像是氣球一樣,中間充滿了空氣。對水生微生物而言,這種蛋白結(jié)構(gòu)能給它們提供浮力。而在科學家的眼中,由于結(jié)構(gòu)中的空氣與細胞中的水分在性質(zhì)上具有天壤之別,這種蛋白結(jié)構(gòu)足以提供超聲成像所需的分辨率。
為了將編碼氣體囊泡的基因轉(zhuǎn)變?yōu)閳蟾婊?,Shapiro和Farhadi做了一件從未做過的事情:將11個基因用于將充滿氣體的蛋白質(zhì)植入到腸道細菌中,然后將修飾的微生物注射到小鼠的腸道中。使用小型超聲波探頭動物腸道中的細菌簇。這一過程充滿了挑戰(zhàn),因為細菌和哺乳動物在其DNA中讀取基因的方式有所不同。
生物讀取“基因密碼”系統(tǒng)不兼容
這一過程充滿了挑戰(zhàn),因為細菌和哺乳動物在其DNA中讀取基因的方式有所不同。這意味著盡管Shapiro和Farhadi可以將細菌DNA插入細胞中,但是這些細胞不知道如何處理該DNA,這類似于為Apple計算機編寫的程序不會在Windows計算機上運行。
Farhadi及其同事給出了解決方法。他們發(fā)現(xiàn),通過將幾種細菌基因與一種病毒中的蛋白質(zhì)縫合在一起,他們可以通過一個啟動子誘使哺乳動物細胞激活這些基因。插入9種細菌基因可以在培養(yǎng)皿中誘導人腎細胞(HEK細胞)產(chǎn)生氣體球。含有氣體囊泡的細胞在超聲下出現(xiàn),而對照細胞則沒有。

超聲圖像顯示基因在小鼠腫瘤的邊緣活躍
為了測試這些細胞在動物中是否可見,研究人員將這些基因轉(zhuǎn)移到病毒改變的人腎細胞中,然后將其注入小鼠體內(nèi)。這些細胞導致腫瘤在嚙齒動物中發(fā)芽。當研究人員用GFP觀察腫瘤時,它們顯示為綠色斑點。超聲提供了更精確的圖像,表明只有腫瘤邊緣的細胞才打開產(chǎn)生氣泡的基因。
新技術(shù)還有待完善
多倫多森尼布魯克健康科學中心的放射腫瘤學家Gregory Czarnota說:“這是一種探測細胞中基因表達的靈巧聲學方法?!钡强茖W家一致認為,這項技術(shù)還存在一些問題,正如加州圣迭戈Salk生物研究所的神經(jīng)科學家Sreekanth Chalasani所說:“這項基因工程很是復雜,如果有一種更加簡單的方法來植入這些基因,我會更樂意使用?!?/p>
蛋白質(zhì)按一定比例編程到細菌基因簇中時,我們必須弄精確這些比例,Shapiro和法哈迪Farhadi說,要弄清這一點,還需耗時數(shù)年的系統(tǒng)過程。既然他們具有有效的基因,他們說他們將能夠使用它們研究腫瘤,免疫細胞,神經(jīng)元和活生物體中其他細胞類型中的基因表達。通過進一步的改進,他們希望世界各地的生物學家將使用超聲波探查模型生物,以研究其自然生物學環(huán)境中的細胞,并希望醫(yī)生有朝一日可以使用超聲波來監(jiān)測患者基于細胞的療法的命運。
超聲波






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