截止2017年5月4日，新三板共有10565家掛牌公司披露了其2016年的年報，其中上海市掛牌公司共有911家。

　　該市掛牌公司年報顯示，911家掛牌公司凈利潤差異比較大，其中凈利潤超過1億元的新三板公司共有6家，分別為合全藥業(yè)、合晟資產(chǎn)、中城投資、益盟股份、威派格和張鐵軍。

　　其中，凈利潤最多的公司是合全藥業(yè)，其凈利潤為4.36億元。合全藥業(yè)為全球主流制藥企業(yè)提供創(chuàng)新藥研發(fā)生產(chǎn)外包服務，該公司于2015年4月3日掛牌新三板。

　　2016年上海市新三板公司凈利潤Top100如下表所示：

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